พ.ศ. 2538 ศูนย์บรรณสารและสื่อการศึกษา มหาวิทยาลัยพะเยา เดิมใช้ชื่อว่าห้องสมุดมหาวิทยาลัยนเรศวร พะเยา โดยเปิดให้บริการ ณ อาคารวิทยาศาสตร์ โรงเรียนพะเยาพิทยาคม เนื่องจากมหาวิทยาลัยนเรศวร พะเยา เริ่มก่อตั้งและมีที่ทําการชั่วคราวอยู่ที่โรงเรียนพะเยาพิทยาคม อ.เมืองพะเยา จ.พะเยา
พ.ศ. 2542 มหาวิทยาลัยนเรศวร พะเยา ได้ย้ายที่ทําการจากโรงเรียนพะเยาพิทยาคม มาอยู่เลขที่ 19 หมู่ 2 ตำบลแม่กา อำเภอเมืองพะเยา จังหวัดพะเยา โดยหเองสมุดตั้งอยู่ที่อาคารเรียนรวมหลังเดิม ชั้น 1
พ.ศ. 2543 ห้องสมุดย้ายมาตั้งอยู่ที่อาคารสํานักงานอธิการบดี ชั้นที่ 1 เนื่องจากมหาวิทยาลัยมีนโยบายปรับปรุงห้องที่เคยเป็นห้องสมุดเดิมให้เป็นห้อง Self Access เพื่อให้บริการคอมพิวเตอร์ค้นคว้าด้วยตนเองแก่นิสิต
พ.ศ. 2544 ห้องสมุดได้ขยายพื้นที่การให้บริการ ออกเป็น 2 ห้อง มีพื้นที่ให้บริการ 648 ตารางวา มีที่นั่งอ่านทั้งหมด 165 ที่นั่ง โดยแบ่งการให้บริการสารสนเทศห้องที่ 1 ให้บริการทรัพยากรสารสนเทศทั่วไป วารสาร หนังสือพิมพ์ คอมพิวเตอร์ ส่วนห้องที่ 2 ให้บริการทรัพยากรสารสนเทศด้านวิทยาศาสตร์สุขภาพ ด้านกฎหมาย วารสารล่วงเวลา หนังสือพิมพ์ล่วงเวลา คอมพิวเตอร์ ซึ่งในปัจจุบันได้แยกออกเป็นห้องสมุดคณะพยาบาลศาสตร์และห้องสมุดคณะนิติศาสตร์
พ.ศ. 2553 ห้องสมุดได้ย้ายที่ทําการมาอยู่ในอาคารหลังปัจจุบัน ซึ่งตั้งอยู่ในกลุ่มอาคารรียนรวมหลังใหม่ (CE) เป็นอาคาร 3 ชั้น มีพื้นที่ทั้งหมด 11,213 ตารางเมตร และในปีเดียวกันนี้ มหาวิทยาลัยนเรศวร พะเยา ได้รับการยกฐานะเป็นมหาวิทยาลัยในกำกับของรัฐ ซึ่งไม่เป็นส่วนราชการตามกฎหมายว่าด้วยระเบียบบริหารราชการแผ่นดิน และได้เปลี่ยนชื่อเป็น “มหาวิทยาลัยพะเยา” ตามพระราชบัญญัติมหาวิทยาลัยพะเยา พ.ศ. 2553 ซึ่งประกาศในราชกิจจานุเบกษา เล่ม 127 ตอนที่ 44ก ลงวันที่ 16 กรกฎาคม 2553 จึงได้มีการแบ่งหน่วยงานในส่วนงานบริหารของมหาวิทยาลัยพะเยา พ.ศ. 2553 ออกเป็น 8 กอง 3 ศูนย์ และ 1 สำนักงาน เพื่อให้การบริหารจัดการมีความคล่องตัว และสอดคล้องกับภารกิจของมหาวิทยาลัยพะเยา ส่วนงานห้องสมุดมหาวิทยาลัยพะเยา จึงได้รับการยกฐานะเป็น “ศูนย์บรรณสารและสื่อการศึกษา”
พ.ศ. 2553 ห้องสมุดได้ย้ายที่ทําการมาอยู่ในอาคารหลังปัจจุบัน ซึ่งตั้งอยู่ในกลุ่มอาคารรียนรวมหลังใหม่ (CE) เป็นอาคาร 3 ชั้น มีพื้นที่ทั้งหมด 11,213 ตารางเมตร และในปีเดียวกันนี้ มหาวิทยาลัยนเรศวร พะเยา ได้รับการยกฐานะเป็นมหาวิทยาลัยในกำกับของรัฐ ซึ่งไม่เป็นส่วนราชการตามกฎหมายว่าด้วยระเบียบบริหารราชการแผ่นดิน และได้เปลี่ยนชื่อเป็น “มหาวิทยาลัยพะเยา” ตามพระราชบัญญัติมหาวิทยาลัยพะเยา พ.ศ. 2553 ซึ่งประกาศในราชกิจจานุเบกษา เล่ม 127 ตอนที่ 44ก ลงวันที่ 16 กรกฎาคม 2553 จึงได้มีการแบ่งหน่วยงานในส่วนงานบริหารของมหาวิทยาลัยพะเยา พ.ศ. 2553 ออกเป็น 8 กอง 3 ศูนย์ และ 1 สำนักงาน เพื่อให้การบริหารจัดการมีความคล่องตัว และสอดคล้องกับภารกิจของมหาวิทยาลัยพะเยา ส่วนงานห้องสมุดมหาวิทยาลัยพะเยา จึงได้รับการยกฐานะเป็น “ศูนย์บรรณสารและสื่อการศึกษา”
พ.ศ. 2556 ศูนย์บรรณสารและสื่อการศึกษา ได้ขยายพื้นที่ให้บริการโดยเปิดให้บริการชั้น 2 และชั้น 3 เพื่อบริการทรัพยากรสารสนเทศตามประเภท และเพิ่มความสะดวกในการค้นหาให้กับผู้ใช้บริการ
พ.ศ. 2557 ศูนย์บรรณสารและสื่อการศึกษา ได้ปรับปรุงโถงทางเข้าและเคาน์เตอร์บริการยืม-คืน ให้ดูสวยงาม ทันสมัย ตลอดจนการเปลี่ยนแปลงชั้นหนังสือให้โดดเด่น สะดุดตาและสะดวกต่อการค้นหาทรัพยากรสารสนเทศ และได้เปิดให้บริการห้องฉายภาพยนตร์ภาษาต่างประเทศในระบบเสียง Soundtrack เพื่อเป็นการส่งเสริมและสนับสนุนให้ผู้ใช้บริการได้ฝึกทักษะการฟังภาษาต่างประเทศ
พ.ศ. 2558 ศูนย์บรรณสารและสื่อการศึกษา ได้ปรับปรุงพื้นที่ให้บริการทรัพยากรสารสนเทศใหม่ ดังนี้ ชั้น 1 ให้บริการหนังสือภาษาไทย ชั้น2 ให้บริการหนังสือนวนิยาย หนังสือพิมพ์ วารสาร หนังสือภาษาต่างประเทศ ชั้น 3 ให้บริการ หนังสือด้านวิทยาศาสตร์สุขภาพ วิทยานิพนธ์ งานวิจัย
พ.ศ. 2559 ศูนย์บรรณสารและสื่อการศึกษา ได้ปรับปรุงพื้นที่ให้บริการทรัพยากรสารสนเทศต่างๆ ให้มีความทันสมัยและเพื่อเพิ่มความสะดวกในการเข้าถึงสารสนเทศของผู้ใช้บริการมากยิ่งขึ้น ดังนี้ 1.เทคโนโลยี RFID (Radio Frequency Identification System) 2.ห้องสมุด miniTCDC 3. หอจดหมายเหตุมหาวิทยาลัยพะเยา